營利事業、機關團體等扣繳單位承租房屋，如約定由承租人負擔扣繳稅款及全民健保補充保費，實質上是承租人因租賃財產所負擔之對價，應以包括扣繳稅款及補充保費在內之給付總額為基礎，辦理扣繳稅款及憑單申報。
舉例說明，A公司向國內居住之房東甲君承租房屋，租賃契約約定10%扣繳稅款及2.11%全民健保補充保費由A公司負擔，甲君每月實收租金新臺幣40,000元，則A公司每月應依實質租金給付總額45,511元〔40,000元÷（1-10%-2.11%）〕計算扣繳稅額4,551元（45,511元×10%）於每月10日前將上一月內所扣取稅款向國庫繳清（若每次應扣繳稅款不超過2,000元者，則免予扣繳），並於次年1月底前辦理扣（免）繳憑單申報。